菊花茶具有行气解郁、调理身体的作用，但是不适宜的应用也可能会导致菊花茶的副作用在人体产生作用。菊花茶的副作用是容易损伤正气、导致胃酸等情况的发生。
1、中医认为菊花味甘苦，性微寒，具有疏散风热、平抑肝阳、清肝明目、清热解毒的功效。现代研究认为，菊花含有多种营养物质，具有抗菌、抗病毒、解热、抗衰老等作用。用菊花泡茶，不宜长期连续饮用，一般3~5天即可。而体质偏寒的人不妨放点枸杞，而脾胃虚寒的人最好少喝。
2、阳虚体质的人，如果一味地喝具有清热泻火功效的菊花茶，容易损伤正气，越喝越虚，尤其是脾胃虚寒的人，多喝性凉的菊花茶还容易引起胃部不适，导致反酸。可见，用菊花茶来降火清热也是有选择的，不能千人一方。
3、喝菊花茶时，有人喜欢加上几颗冰糖以增加口感。菊花茶加冰糖是可以的，但是对于患有糖尿病或血糖偏高的人，最好别加糖，单喝菊花。此外，还有一些脾虚的人也不宜加糖，因为过甜的茶会导致这类人口黏或口发酸、唾液增多，感到不适。所以，不清楚自己体质的人喝菊花茶还是别加冰糖为好。冲泡菊花茶时直接以热水冲泡即可。
